Ce fonds est divisé en trois séries qui témoignent de la vie personnelle et professionnelle de Jean-Baptiste Phaneuf. La première série comprend des éléments relatifs à sa vie personnelle, comme des documents photographiques de sa vie étudiante au Séminaire de Saint-Hyacinthe, ainsi que de membres de sa famille. Nous y retrouvons également de la correspondance familiale et des notices biographiques de certains de ses ancêtres. La seconde série porte sur la vie professionnelle de Jean-Baptiste Phaneuf. Elle contient divers documents en lien avec ses années de pratique et d’enseignement de la médecine vétérinaire. La troisième et dernière série porte sur les conférences et les recherches faites par Jean-Baptiste, dont quelques-unes concernent les rues de Saint-Hyacinthe et d’autres la région de Saint-Denis-sur-Richelieu.